6月8日 举行敦煌种业种子加工中心奠基仪式。 

7月3日 经省地税局审核，从2002年1月至2002年12月期间免征企业所得税。 

8月 敦煌种业张掖分公司成立。 

8月16日 公司被农业部列入全国33家棉花及棉种加工经营示范企业之一。 

8月28日 公司成功注册 “敦煌飞天”商标。 

10月20日 全国人大代表《种子法》检查组来公司检查种子法执行情况。 

11月 副省长宋小系一行到敦煌种业种子加工中心视察。 

11月16日  敦煌种业种子加工中心落成。 

12月12日  首次股票发行获证监会发审委通过。 

12月30日  6类19个品种种子搭载神舟四号进入太空，实施航天育种。 

12月31日 公司被国家九部委正式批准为农业产业化国家重点龙头企业。 

2001年 

4月18日 取得省计委核发的《棉花经营许可证》。 

6月15日 召开2000年度股东大会，审议通过了《敦煌种业2000年度工作报告》、《董事会2000年度工作报告》、《监事会2000年度工作报告》等11项议案。根据《公司章程》增选6名董事，其中独立董事3人，增选董事成员为：董事姜泉庆、张绍平、独立董事赵昌文、孙其信、曹致中。报告显示，2000年公司实现主营业务收入3.96亿元，净利润2837万元。 

7月12日 经省地税局审核，从2001年1月至2001年12月期间免征企业所得税。 

7月21日 公司制订的《粮食作物种子 禾谷类》、《经济作物种子 棉花》、《经济作物种子油料类》、《瓜菜作物种子》、《主要蔬菜杂交种子》等5项企业标准。 

8月4日 国家农业部产业化司陈司长及省农牧厅产业化处处长陈浩民一行来公司视察。 

8月22日 美国先锋公司生产部主任戴维先生一行来访。 

8月30日 取得农业部颁发的《农作物种子经营许可证》。 

9月 29日 被建行甘肃省分行评定为AA级客户信用等级。 

10月26日董事长王大和参加中国·潍坊全国农业产业化现场经验交流会。 

12月26日 根据公司股东大会决议，报经省政府体改办批准，公司将现有股本按照1：0.72比例缩减。股本缩减后，本公司股本由15412万股变更为11096.64万股。 

11月16日 取得《自理报关单位注册登记证明书》、《中华人民共和国进出口企业资格证书》。

2000年 

3月19日 与西南证券有限责任公司签订《股票发行上市辅导协议。 

4月24日 召开1999年度股东大会，审议通过了《敦煌种业董事会1999年度工作报告暨2000年度工作安排》、《监事会1999年度工作报告》等6项议案。1999年度报告显示，1999年公司实现主营业务收入4.596亿元。 

8月  公司迁至酒泉市盘旋东路10号。 

1999年  

4月12日 召开1998年度股东大会，审议通过了《董事会1998年度工作报告及1999年度工作安排》、《敦煌种业股东大会议事规则》等4项议案。  

1998年  

12月 经省政府甘政函[1998]92号、省体改委甘体改发[1998]041号文批准，同意设立甘肃省敦煌种业股份有限公司。  

12月26日 召开创立大会暨第一届股东大会。大会经过有效表决，通过了《公司筹委会关于公司筹建工作报告》、《公司章程》等决议。选举王大和、段学义、陈海明、张汉金、孙志祥为公司第一届董事，选举孟宪中、马成清、关雪峰、赵积信为监事，确认王乾出任职工监事。