7月10日 二届董事会2004年第一次临时会议审议通过，公司决定成立甘肃省敦煌种业股份有限公司棉花销售分公司，

7月15日 甘肃省上市公司协会章程规定吸纳敦煌种业为协会会员。 

9月1日 经省地税局审核，同意从2004年1月至2004年12月期间免征企业所得税。 

10月14日 成立酒泉敦煌种业棉蛋白油脂有限公司。 

10月27日 成立敦煌种业种子营销分公司。 

11月3日 成立武汉敦煌种业有限公司。 

11月4日 与河北金田种业合作成立河北敦煌种业有限公司。 

2003年  

1月10日 全国农业产业化联席会议九部联合举行新闻发布会，公布农业产业化国家重点龙头企业的监测认定结果，我公司正式成为第二批农业产业化国家重点龙头企业之一。 

2月18日 中国航天育种中心将搭载种子移交敦煌种业。 

3月6月 公司被省农业产业化工作领导小组办公室评定为“甘肃省农业产业化重点龙头企业”。 

3月19日 在敦煌种业五楼会议室举行敦煌种业搭载育种材料试验研究项目启动仪式。 

3月29日 中国证监会兰州特派办马才斌主任一行来公司视察。 

4月14日 召开2002年度总结表彰大会。

4月29日 召开2002年度股东大会。大会审议通过《董事会2002年度工作报告》、《监事会2002年度工作报告》、《2002年度财务决算报告》等9项议案。报告显示2002年公司实现主营业务收入5.56亿元，实现利润总额4264.49万元，税后净利润3411.51万元。 

5月8日 敦煌种业安西万吨优质棉种繁育加工项目奠基仪式在安西举行。 

5月30日 省长助理陈有安一行视察敦煌种业种子加工中心。 

6月14日 省委书记宋照肃一行视察公司种子加工中心。 

7月 副省长员小苏一行视察敦煌种业种子加工中心。 

7月 新疆自治区刘副主席参观种子加工中心。 

7月11日 公司被甘肃省政府认定为甘肃省第一批农业产业化重点龙头企业，列为重点扶持的十大农业产业化龙头企业之一。 

8月 被农业部列为全国33家棉花及棉种加工经营示范企业之一。 

8月7日 经省地税局审核，从2003年1月至2003年12月期间免征企业所得税。 

9月18日 公司被中国种子协会评为“2003年种业50强”。 

9月28日 中国证券监督管理委员会证监发行字[2003]126号文件核准公司向社会公开发行人民币普通股股票7500万股。 

12月8日   敦煌种业安西优质棉种繁育加工厂落成。

12月8日  酒泉市政府授予甘肃省敦煌种业股份有限公司“酒泉市农业产业化重点龙头企业”。 

12月20日 公司被省银行业协会授予甘肃省银行业“诚信客户”称号   

12月25日 下午14：00-18：00，敦煌种业新股发行网上路演在上海举行。 

12月29日 7500万A股在上海证券交易所首次公开发行，发行价格：5.68元/股，沪市配售代码：737354，深市配售代码：003354。 

12月31日 召开二届五次董事会决议，决定设立敦煌种业会计核算中心和资金管理中心。 

2002年  

2月1日 与新乡市农科所共同组建了黄淮海玉米育种站。 

2月8日 召开2001年度经理会暨年度总结表彰大会。 

3月9日 召开2001年度股东大会，审议通过《敦煌种业2001年年报》、《董事会2001年度工作报告暨2002年度计划》、《监事会2001年度工作报告》等12项议案。大会选举王大和、姜泉庆、赵明、段学义、陈海明、赵开新、关雪峰、张绍平、王建现为公司第二届董事会董事；选举孙其信、曹致中、赵昌文、刘存有为公司第二届董事会独立董事；选举孟宪中、杜强基、李中、李清泽、李森、于生刚为公司第二届监事会股东代表监事，并根据公司职工代表大会决议确认王乾、李文、张振堂为公司第二届监事会职工监事。